2.1. Чакрата „хилядолистник“, наричана още коронна, е вратата, през която човек получава Божествената енергия. С нея е свързана епифизата.37 Тя е най-мистичната жлеза с вътрешна секреция. Тази жлеза е разположена над и зад хипофизата. В древността са я наричали „третото око“.
По този повод Учителят П. Дънов казва:
„В средата на човешкия мозък се намира тъй нареченото „летящо око на душата или вътрешното слънце на човека“. Ако това слънце не грее в човека, нищо не става от него. То играе ролята на трансформатор в човешкия организъм. Когато външната енергия прониква в мозъка на човека, този възел или окото на душата препраща тази енергия по целия мозък. То има и други свойства, освен това – да трансформира слънчевата енергия. В мозъка има и друг трансформатор, който препраща слънчевата енергия по цялото тяло[…].38
Човешкият мозък в своето развитие има цяла история. Първоначално е принадлежал към царството на нисшите животни. Веществото, от което се е образувал мозъкът, се е събирало в продължение на милиони години, за да придобие човек, малко по малко, способността да мисли.“
Пинеалната жлеза (eпифиза) контролира и управлява функциите на другите жлези с вътрешна секреция. Ето защо я наричат „висшия контрольор“. Тя действа върху целия организъм.
2.2. Хипофизата в триизмерния свят представлява главната антена на човешката личност и нейната поляризация във физическия свят.
Предната част на хипофизата е носител на мощни вибрации на висшата творческа мисъл, която одухотворява материята: мъжественост, воля, устрем – движещ принцип на човешкия прогрес, творческият принцип на бащата.
Задната част на хипофизата ни разкрива необятните простори на въображението, на интуицията, на нежността, на красотата и на магнетизма – емблема на майчиното чувство, пазителка на живота – женският принцип.
Повечето от жлезите с вътрешна секреция имат отношение към физиологичните и подсъзнателните процеси. Хипофизата и епифизата са свързани с психичното и духовното състояние на човека.
2.3. Гърлената чакра, чийто физически орган е щитовидната жлеза, управлява функциите на бронхите, белите дробове и други. Когато тази жлеза е в състояние на хармония, тя улеснява пробуждането на разумните творчески сили на човека и го стимулира да ги реализира на физически план.
2.4. Сърдечната чакра. Физическият орган е тимусната жлеза. Тя регулира функциите на сърцето и на кръвообръщението. Чрез този център, който представлява символично „светлата стаичка“, „скришното място в човека“39, става посвещението на сърцето. „Енергиите на организма, превърнати в сублимирана материя, ще служат за развиване на основните качества на Новата Култура, която е култура на Любовта. До този момент човешкото същество се е концентрирало най-вече върху своето его – низшия си аз, а сега то вече е готово за самопожертвувание и себеотдаване. Тогава ще му се разкрият законите, които направляват силите на изобилието.“
2.5. Чакрата на слънчевия сплит регулира вегетативната нервна система. Тя извлича низшите енергии.
2.6. Сакралната чакра, която се намира в основата на гръбначния стълб, управлява функциите на репродуктивната система.
2.7. Базисната чакра, която се намира в най-долната част на гръбначния стълб, регулира функциите на бъбреците и на гръбначния стълб.